Es la invulnerabilidad de ciertos microbios al efecto de los mismos. Si bienes un proceso natural, que hasta hace poco no había causado mayores problemas porque los microbios aún no son resistentes a todos los antibióticos, existen recomendaciones de antibióticos a usar, teniendo en cuenta el agente infeccioso. Estas recomendaciones están basadas tanto en la eficacia de un compuesto como en la biología de la bacteria a tratar.